在国家863计划支持下，我国科研人员采用BLUP和MAS技术，并与肉质和繁殖性状的分子标记辅助选择相结合，成功选育出优质瘦肉型猪新品系。 通过BLUP和MAS与分子标记辅助选择相结合，探索了多基因合并基因型的途径，并在采用肌细胞膜受体标记技术（S100和CAM）及定位分析技术评价肌纤维直径和肌内脂肪与?度和风味相关性的基础上，建立了优质瘦肉型猪新品系培育技术体系。在猪3、4、7号染色体上定位了5个影响猪肌肉品质性状的QTL，分离克隆了3个猪新基因，筛选出5个与猪生产性状显著相关的分子标记，应用所筛选的分子标记，在品系群中进行了分子标记检测和遗传效应分析，培育了8个优良肉质瘦肉型猪新品系。开展了选育品系免疫抗病性方面的研究。通过选育品系与大白猪免疫指标的差异比较分析，新选育的品系优质、抗病，其体液免疫、细胞免疫都显著高于外来品种大白猪。太湖猪/淮猪等优质瘦肉型新品系和配套系选育已进入3－4世代，从分子水平上选择出抗应激、繁殖性能好的种猪－－中育猪配套系1号（CB01）。培育的新品系猪具有饲料报酬高、繁殖性能好、肉质好的优良特性，满足了市场需求。其中中育猪配套系于2004年10月通过了国家猪品种审定专业委员会的审定，对提高我国养猪业的水平将起到积极作用。