全国性遗传评估和场内评估要求采用多性状动物模型最优线性无偏预测法（MTBLUP）估计个体育种值。

生长性能育种值估计模型如下：

y_ijklm=µ_i+hyss_ij +l_ik+g_il +a_ijklm+ e_ijklm

    其中：

i: 第i个性状（1=达100kg体重日龄，2=达100kg体重活体膘厚）

y_ijklm：个体生长性能的观察值

µ_i ：总平均数

hyss_ij：出生时场年季性别固定效应

l_ik：窝随机效应

g_il：虚拟遗传组固定效应

a_ijklm：个体的随机遗传效应，服从（0，A ）分布，A指个体间亲缘关系矩阵

e_ijklm：随机剩余效应，服从（0，I ）分布

达50kg日龄的场内遗传评估可以参照该模型进行。

    母猪繁殖性能育种值估计模型如下：

    y_ijk=µ+hys_i+l_j+a_ijk+p_ijk+e_ijk

    其中：

y_ijk ：总产仔数的观察值

µ ：总平均数

hys_i： 母猪产仔时场年季固定效应

l_j：母猪出生的窝效应，服从（0，I ）分布

a_ijk：个体的随机遗传效应，服从（0，A ）分布，A指个体间亲缘关系矩阵

p_ijk：母猪永久环境效应，服从（0，I ）分布

e_ijk：随机剩余效应，服从（0，I ）分布

其它繁殖性状的场内遗传评估可以参照该模型进行。

    上述估计模型所需的各种遗传参数，目前先参考国外已有的参数，当全国遗传评估中心的资料积累到一定程度后，可考虑采用DFREML等方法估计适合国内情况的遗传参数。